Næsten alle hørte om alkymi, og få tror på, at der kan skabes guld ud fra en slags filosofsten. Spil fra Alchemist`s Village giver dig midlertidigt droppe skepsis og blive bekendt med den rigtige alkymist Patrick, der bor i et magisk land. Han brugte hele sit liv på at søge en universel formel, og efter at have mistet håbet om at gengive den, besluttede han sig for at henvende sig til den mest talentfulde videnskabsmand, der beskæftiger sig med alkymi ved navn Samuel. For at gøre dette bliver han nødt til at gå til landsbyen, hvor alkymisten bor. Men ved ankomsten finder helten ud af, at den, som han havde store forhåbninger til, er dødssyg og ikke engang kan tale. Men der er hans notater om resultaterne af forskning, der skal findes.