Den flyvende tallerken har fløjet i mange måneder på jagt efter planeter, hvor i det mindste noget liv glimter. Indtil nu var flyvningen rolig og endda lidt kedelig i tomme kolde rum, men pludselig dukkede nogle mærkelige bygninger op lige i tomrummet. Besætningsmedlemmerne var lidt overraskede og besluttede at udforske dem, og du kan hjælpe dem med dette i Flappy UFO. Barriererne er placeret over for hinanden i forskellige højder. Mellem dem er der et frit mellemrum, hvorigennem du forsigtigt kan føre skibet for ikke at ramme hverken oppefra eller nedefra. Opgaven er at flyve den maksimale distance i Flappy UFO.