Jernbanen er en af de billigste og mest populære transportformer. I Railroad Crossing 3D vil du være i stand til at køre en jernbaneoverskæring. Dette er stedet, hvor skinnerne krydser motorvejen. I sådanne kryds er der risiko for kollision, så der er monteret særlige barrierer. Du vil administrere dem for at sikre trafiksikkerheden. I nederste venstre og højre hjørne er trafiklys, der skal skiftes, afhængigt af togs bevægelse. En rød pil vil advare dig om togets nært forestående tilgang, som vil dukke op direkte på skinnerne og angive, hvor toget vil bevæge sig fra. Luk barriererne ved at klikke på begge trafiklys for at forhindre biler i at bevæge sig, mens toget bevæger sig i Railroad Crossing 3D.