Efter Marios optræden i spillelokalerne, blev alle blikkenslagere friske op og blev stolte af deres fag. I dag drømmer enhver blikkenslager om at blive den samme som den legendariske spilfigur, og vores helt i Ninja Plumber er ingen undtagelse. Han har flere chancer end resten. Han er jo ikke en simpel blikkenslager, men en ninja. Helten klatrer behændigt op i rør, og det vil også være nemt at hoppe og løbe langs platformene og samle mønter. Ud over mønter skal du passe på specielle svampe, der kan dukke op fra en blok med et tegnet spørgsmålstegn. Denne svamp vil gøre en superhelt ud af en helt. Hop på fjender eller kast shurikens efter dem, og flyt i slutningen af niveauet for at gå videre til den næste i Ninja Plumber.