Spillet Bubble Shooter sender dig til et dystert og uhyggeligt sted. Det ser ud til, at navnet i sig selv skulle foreslå en sjov kamp med flerfarvede bobler, og det venter på dig. Men de onde runde spøgelser vil fungere som bobler, som af en eller anden grund blev mere aktive på den lokale kirkegård. Dem bliver der flere og flere af, og hvis der ikke bliver gjort noget ved det, hvem ved, hvilke konsekvenser det kan få. De lokale har bedt dig om at håndtere problemet, da du er en berømt spøgelsesjæger. Du har en kanon og et sæt tæmmede spøgelser i dit arsenal, som du vil bruge til at skyde på en gruppe oprørske ånder. Hvis der er tre eller flere identiske spøgelser i gården, forsvinder de i Bubble Shooter.