Hemmelige agenter forsøger at holde lav profil og opererer i stilhed, indsamler information og videregiver dem til deres efterretninger. Men som regel, før eller senere, kan enhver, selv den mest succesrige og intelligente agent, blive opdaget. Derfor forbereder spioner deres flugtveje på forhånd. Ikke altid går alt glat, nogle gange skal man skyde, selvom spionerne forsøger at undgå dette. I spillet Secret Agent hjælper du agenten, som har fuldført sit arbejde, med at komme ud af fjendens lejr. Han var uheldig, nogen lækkede oplysninger om hans aktiviteter, og han havde ikke tid til at flygte i tide. Du bliver nødt til at kæmpe, og du vil hjælpe helten med at kæmpe tilbage. Der er en begrænset mængde ammunition, du skal spare penge ved at bruge ricochet i Secret Agent.