Raven, Robin, Starfire, Cuborg og Beast Boy ligner alle hinanden i Teen Titans Go! : Ninjarun, fordi de havde ninja-kostumer på. Nu er det ret svært at skelne de unge titaner fra hinanden. Men du skal bare klikke på den valgte helt, og hans navn vises nedenfor. På denne måde kan du vælge en af de fem karakterer til yderligere handlinger. De repræsenterer et løb langs en vej med forhindringer, og for hver karakter vil de være individuelle og forskellige fra de andre. Du skal hjælpe helten med at omgå, hoppe og dukke i Teen Titans Go! : Ninjarun.