Den modige ninja Kyoto-kriger skal trænge ind i fjendens område og gennemføre rekognosering. Du i Ninja War-spillet bliver nødt til at hjælpe ham i dette eventyr. Din helt, som gradvist vinder fart, løber langs stien. På hans vej vil der være dukkert i jorden og andre farlige sektioner placeret på vejen. Ved at klikke på skærmen bliver du nødt til at få den til at hoppe over alle disse farer. Så snart du møder en fjendens soldat, skal du klikke på skærmen med musen. Derefter kaster din karakter stjerner mod fjenden og dræber dem.