I den fjerne fremtid på planeten Mars begyndte de jordiske kolonister at leve og udvinde forskellige mineraler. Men som det viste sig, er vi ikke alene i universet, og planeten blev angrebet af udlændinge. Din karakter var i deres skibes landingszone og nu i spillet Mars Defense 2: Aliens Attack vil vi kæmpe imod dem. Du vil se, hvordan udlændinge kommer ud af skibene og straks angribe dig. Du bliver nødt til at målrette din pistol på dem og skyde for nederlag. Så du vil ødelægge dem på afstand. Hvis du taber objekter fra monstre, skal du samle dem.
