Thomas bor i en lille by og ejer sin gård. På den vokser han hvede, opdrætter husdyr og selvfølgelig har han en stor have, hvor forskellige frugttræer vokser. Om aftenen fjernede han høsten af frugt og bær, der ville tage dem til markedet om morgenen. Men her er besværet om morgenen, tyve kom til ham og stjal hele høsten. Nu i spillet Farmer's Journey skal vi forfølge dem. Vores helt bevæbnet med en økse løber langs vejen. På den vil frugt komme over, og på dem vil han være i stand til at bestemme, hvor tyvene bevæger sig. De vil samle dem. Alle hindringer på vejen, han bliver nødt til at omgå, hoppe eller hugge med øksen.
