En lille arabisk by blev fanget af en stor gruppe terrorister. De ønsker at installere deres træningscenter her og herfra begå deres forbrydelser i deres egen verden. Uanset hvad der skete med deres fjernelse, blev der sendt en særlig task force til opgaven med at ødelægge kriminelle. Du i spillet Counter Terrorist Strike vil være i stand til at deltage i denne kamp. I spillet er der et valg på hvilken side du vil kæmpe. Hvis det for eksempel er en specialstyrkesoldat, skal du som en del af løsningen trænge ind i byens gader og bruge skydevåben og sprængstoffer til at ødelægge terrorister. Hvis du tværtimod spiller for kriminelle, så skal du afvise angrebet og ødelægge soldaterne.