Du er i en af de menneskelige bosættelser, der er efterladt på jorden lidt efter en storstilet infektion med T-viruset, som forvandlede næsten halvfems procent af menneskeheden til zombier. De døde angriber jævnligt dine fæstninger, og du skal stoppe dem. Nu vil bare en anden bølge gå, og du skal afspejle det i spillet Zombie Waves 3D. Mow de løbende zombier uden at lade dem gå gennem forsvaret, hvor du har et svagt punkt. De døde begyndte at bevæge sig hurtigt, hvilket er meget mistænkeligt, det virker som om de muterer og bliver stærkere.
