I det gamle Japan var der en militær orden, der specialiserede sig i spionage og mord på forskellige mennesker. De blev kaldt ninjaer. Mange ordenskrig var i den hemmelige tjeneste for kejseren af Japan. I dag i spillet Flight Of The Ninja, hjælper vi en af dem i udførelsen af en hemmelig mission. Din helt skal ind i det bevogtede slot, som står på et bjerg. For at gøre dette skal han klatre op i de rene vægge, der er fyldt med fælder. Din helt ved hjælp af specielle kroge vil forsigtigt klatre op ad væggen. Så snart han når fælden, skal han klikke på skærmen og få ham til at hoppe og hoppe til en anden væg.
