En lille grøn alien, der rejser rundt i galaksen for at opdage nye planeter, faldt i anomali. Nu skal du i spillet Aliens Bubble Shooter hjælpe ham med at redde sit liv og bevare skibets integritet. Din karakter vil se en barriere i form af multi-farvede strømbobler, der bevæger sig i retning af hans skib. Du bliver nødt til at ødelægge dem og rydde vejen. For at gøre dette vil du bruge den luftbårne kanon til at skyde specielle skaller. De vil også have farve. Når et projektil rammer en bestemt farve i nøjagtig de samme farveboller, vil du blæse dem op og du får point.
