Vores helt flyttede med sine forældre til en anden by, og han er nødt til at vinde respekt for fyre for at få venner. Han vil bevise over for surfingens selskab, at han fortjener at blive optaget i deres firma. Han blev tilbudt at gennemgå test på en forladt metrolinje, der kører delvist på overfladen og i fangehullet. Der kører ingen tog der, men sporene er fulde af alle slags forhindringer, som du bliver nødt til ikke kun at hoppe over, men også dykke eller klatre gennem dem. Hjælp drengen i Subway Runner med at løbe den maksimale afstand. Saml mønter og køb opgraderinger, og når du har samlet en tilstrækkelig mængde, kan du endda ændre billedet.
