Rejser gennem undervandsriget, havfrue-prinsessen er i problemer. Kemisk væske fra en flydende tankskib spildte på den, og hun blev såret. Du i Princess Mermaid Accident ER bliver nødt til at tage sig af hendes behandling. Først og fremmest bliver du nødt til at besøge afdelingen og nøje undersøge prinsessen for at gøre hende til en diagnose. Først derefter skal du bruge et specielt medicinsk instrument og medicin til at udføre et sæt handlinger, der sigter mod at behandle vores prinsesse.