Børneselskabet har bygget en lille raket og vil nu teste den. Du i Flappy Rocket vil hjælpe dem med dette. Din opgave er at føre raket langs en bestemt rute og flyve så langt som muligt. For at holde flyet i luften eller få det til at højde, skal du klikke på skærmen med musen. Hindringer vil vises på banen til raketbevægelse. I dem vil du se passager. Du bliver nødt til at rette et missil mod dem og ikke lade det kollidere med disse objekter.
