Den modige ninja modtog en ordre fra lederen af u200bu200bsin ordre om at trænge ind i aristokratens borg og stjæle dokumenter der. Du i Ninja Run Up And Down vil hjælpe ham i disse eventyr. Din karakter bliver nødt til at løbe til slottet langs en vej, der passerer gennem et bestemt område. På vejen kommer han over forskellige fælder og monstre. Når du løber op til dem bliver du nødt til at tvinge din helt til at hoppe og flyve gennem luften gennem alle disse farer.
