Den lille pige Mary besluttede at besøge sine fjerne slægtninge. Da hun rejste sig tidligt om morgenen og klædte sig på, rejste hun. I Mary Run hjælper du hende med dette eventyr. Foran dig på skærmen vil du se vejen, som din pige kører langs, gradvis øge hastigheden. En række fælder og forhindringer vil støde på undervejs. Du bliver nødt til at bruge kontroltasterne til at tvinge pigen til at udføre visse handlinger. Din pige bliver nødt til at hoppe over fælderne på vejen. Hvis der er en hindring i hendes sti, kan pigen klatre op på den. Forskellige mønter og andre genstande vil blive placeret overalt på vejen. Du bliver nødt til at få pigen til at samle dem alle sammen.
