En primitiv mand ved navn Adam, der gik gennem skoven, blev angrebet af udlændinge. De var i stand til at lade vores helt sove og transportere ham til deres skib. Nu har Adam brug for at flygte fra udlændinge for at vende tilbage til sin elskede Eva. I Adam & Eve Aliens hjælper du ham på dette eventyr. Adam vågnede og befandt sig i skibets værelse. Han bliver nødt til at prøve at komme ud af det. For at gøre dette skal du åbne dørene. For at dørene kan åbnes, har din helt brug for visse ting. For at finde dem bliver du nødt til helt at søge i rummet og løse bestemte slags gåder og gåder. Så snart du finder genstandene og åbner passagen, bliver din helt transporteret til det næste niveau i spillet.