I en fjern vidunderlig verden lever en unik slange, hvis krop består af mange bolde. I dag går hun på en rejse, og i spillet Snake Ball 3d hjælper du hende med dette. Du vil se det område, hvor din slange vil være placeret. Hun vil kravle fremad og vinde hastighed. Undervejs venter forskellige forhindringer på hende. Ved hjælp af kontroltasterne vil du tvinge din slange til at gå omkring dem og forhindre kollisioner med dem. Nogle gange vil der være forskellige ting og mad på vejen. Du er nødt til at gøre det, så slangen forbruger dem. Således øger du størrelsen og får andre nyttige bonusser.
