En krig brød ud mellem dit land og en naboland. I spillet Atari Missile Command vil du lede forsvaret af den militære base, hvor du tjener. Foran dig på skærmen vil du se bygningerne på din base og raketvåben installeret overalt. Fjenden har affyret en masse raketter mod din base, som du vil vises på himlen. Du bliver nødt til at skyde dem alle ned og forhindre dem i at falde ind i basens område. For at gøre dette ved hjælp af musen vil du indstille synet for dine installationer ved hjælp af blå kryds. Åben ild, når du er klar. Hvis dit syn er nøjagtigt, vil du skyde fjendens missiler ned og få point for dette. Efter at have samlet et vist antal af dem opgraderer du dine installationer og ammunition til dem.
