Ved at forsvare Jorden fra fremmed invasion tænkte Ben på en eller anden måde ikke over de statslige efterretningstjenesters rolle, og de slumrede ikke. Drengen var længe kommet ind i deres synsfelt, og de havde en plan om at rekruttere helten. Fyren er dog ikke interesseret og har ikke brug for det. Derudover kan Omnitrix ikke overføres til nogen, det fungerer kun med Ben's DNA. Men hemmelige tjenester ønsker ikke at vide noget, de har til hensigt at gribe Ben, låse ham op og tvinge ham til at arbejde for dem. Dette kan ikke tillades, og du vil hjælpe helten i spillet Mr. Ben 10 med at undgå fangst. Helten bliver nødt til at tage våben for at fjerne alle agenter, der prøver at få fat i fyren. Den pistol, der vises i drengens hænder, er usædvanlig. Med en kugle vil han være i stand til at lægge flere på én gang i Mr. Ben 10.
