I en fjern fremtid, efter en række verdenskrige og katastrofer, hersker ødelæggelse på Jorden. Mange mennesker døde, og efter døden blev de levende døde. Nu strejfer horder af zombier overalt og jager efter de overlevende mennesker. I spillet Zombies Don't Run bliver du transporteret til det tidspunkt og vil hjælpe en ung fyr ved navn Jack med at overleve i denne fjendtlige verden. Din karakter vil være synlig på skærmen foran dig, der løber langs vejen og gradvis får hastighed. Fyren har en flagermus i sine hænder. På hans vej vil der være forskellige slags forhindringer, som din karakter bliver nødt til at undgå. Zombier angriber ham. Ved hjælp af kontroltasterne bliver du nødt til at tvinge din kæreste til at ramme zombierne med en flagermus. Således vil han dræbe dem, og du vil modtage point for dette.
