Lille dreng Thomas, der rejser gennem skoven, opdagede en lille Pokemon. Drengen fik venner med ham og hjælper nu Pokémon med at vokse. I dag skal de gå til den magiske eng og hente mad til Pokémon der. I spillet Pukiimon vil du slutte dig til dem på dette eventyr. Foran dig på skærmen vil du se en rydning placeret i skoven. Maden flyver ud fra forskellige retninger. Hun vises i forskellige højder og flyver i forskellige hastigheder. Du bliver nødt til hurtigt at reagere ved at klikke på den med musen. På denne måde opdeler du objekter i lige store dele, som derefter falder i pokemonens poter. Hvert af dine hits evalueres med et bestemt antal point.
