I den fjerne fremtid begyndte løb på forskellige fly at nyde særlig popularitet. De blev overværet af jordboere og udlændinge fra forskellige planeter i galaksen. I dag i Cosmic Racer 3D rejser du tilbage til disse dage og deltager selv i en række løb. En spilgarage vises på skærmen foran dig, hvor du kan vælge et køretøj efter eget valg fra de enheder, der er til rådighed at vælge imellem. Derefter vil du skynde dig på dit skib langs et specielt bygget spor. Det vil have mange skarpe sving, som du bliver nødt til at overvinde i hastighed og ikke flyve væk fra vejen. Du bliver også nødt til at samle forskellige genstande spredt langs din vej. De giver dig point og kan give dig forskellige bonusser.
