SpongeBob inviterer dig til sin hjemby Bikini Bottom, hvor stickman-løb begynder lige nu i SpongeBob SquarePants City 3D. Den blå mand er allerede i starten og venter på, at du tager ansvar for hans bevægelse langs den snoede vej. Gule spidse stave vokser med jævne mellemrum og skjuler sig derefter. Man skal løbe, når de ikke er farlige. Derudover vil der være andre forhindringer, ikke mindre farlige. Beboerne i byen vil se løbet, du vil bemærke Svidward, Plankton og andre tegn, der er velkendte for dig på sidelinjen. Lad dem ikke distrahere dig fra at overvinde forhindringer, ellers forbliver løberen på plads i SpongeBob SquarePants City 3D.
