Der er nok skurke i Gotham, og så snart Batman formår at håndtere en, dukker en ny, mere opfindsom og farlig op. Denne gang i Batman Color Fall opstod et ukendt geni, der besluttede at ødelægge floden, der løber gennem byen. Han har til hensigt at dumpe tonsvis af giftig flerfarvet væske i vandet, som vil dræbe alle levende ting, og der vil dukke en skidt sump frem i stedet for floden. Den giftige væske er allerede hældt i cisterner, som er placeret forskellige steder over floden. Batman formåede at finde dette geni og håndtere ham, men nu skal han tømme den farvede væske og tage den så langt fra byen som muligt. Kør bådene og tøm løsningerne ved at åbne de nødvendige spjæld. Farven på væsken skal matche farven på båden i Batman Color Fall.
