En hemmelig agent ved navn Guy skal gennemføre en række svære missioner i dag. I spillet Secret Agent Guy hjælper du ham på dette eventyr. Havoverfladen vil være synlig på skærmen foran dig. Din karakter vil være under vandet i en vis dybde. Han vil have en iltbeholder på ryggen og en spydpistol i hænderne. Ved hjælp af kontroltasterne får du din helt til at svømme fremad. Se omhyggeligt på skærmen. Dybhavsminer vil dukke op foran dig, som din helt bliver nødt til at flyde side om side. Hvis du støder på fjendens dykkere, kan du ødelægge dem ved at skyde dem med din pistol. For dette vil du få point, og du vil gå til næste niveau.