Agents of the Matrix drev Neo i en fælde, og nu bliver han nødt til at tage kampen. I Mr One Punch hjælper du ham med at besejre alle rivaler og undslippe forfølgelsen. Din karakter vil være synlig på skærmen foran dig, som vil være på et bestemt sted. Agenter vil angribe ham fra alle sider. Ved at bruge heltens færdigheder i forskellige stilarter af hånd-til-hånd kamp, bliver du nødt til at slå på dem. Da der er mange modstandere, så prøv at slå dem ud med et slag. Hver fjende, du besejrer i Mr One Punch, giver dig point.
