Den modige samurai Kyoto må i dag infiltrere stedet for Yakuza og ødelægge bandens regerende elite. Du i spillet Samurai Flash Online vil hjælpe ham på dette eventyr. Foran dig på skærmen vil du se din karakter bevæbnet med to sværd. Ved hjælp af kontroltasterne styrer du hans handlinger. Du bliver nødt til at bevæge dig fremad, indtil du møder en fjende. Så snart dette sker, bliver du nødt til at angribe ham. Slår du slag med dine sværd, vil du nulstille fjendens livbar, indtil du ødelægger ham. For at dræbe en fjende i spillet Samurai Flash Online får du point, og du kan hente trofæerne, der er faldet fra den.
