En kanin ved navn Roger besluttede sig for at løbe gennem dalen, hvor han bor, og genopbygge madforsyningerne inden vinteren. Du i spillet Run Rabbit Run vil hjælpe ham med dette. Et bestemt område vil dukke op foran dig på skærmen, hvor din karakter vil være placeret. Ved hjælp af kontroltasterne vil du få din kanin til at løbe fremad gradvist og få fart. På dens vej vil der opstå forskellige forhindringer og andre farer. Ved at kontrollere kaninens handlinger vil du få ham til at hoppe over alle disse farer. Du vil se spredte gulerødder og anden mad overalt. Du skal samle alle disse genstande og få point for det.
