Ninjaer er kendt for deres springevner selv uden specielt udstyr, men hvad sker der, hvis du forsyner en fingernem ninja med en speciel hoppepind. I Hopping Ninja skal du finde ud af det. Helten vil have en pogo-stick-jumper til sin rådighed. Dette transportmiddel er nyt for helten, og han har ikke haft tid til at mestre det endnu. Du vil hjælpe ninjaen med at passere niveauerne ved at bruge jumperen til at overvinde forhindringer. Ved at klikke på helten får du ham til at hoppe, mens det er vigtigt at lande på en pind, og ikke på hans hoved. Vip stokken fremad for at flytte i stedet for at hoppe på plads. Det vil være lidt svært i starten, men du vil vænne dig til Hopping Ninja.