Oftest i spil af flyvende fugle-genren skal du hjælpe en eller anden fugl med at overvinde vanskelige luftveje, flyve gennem snævre huller og forsøge ikke at ramme forskellige forhindringer. I Flapi Smash vil du gøre alt omvendt. Opgaven er ikke at gå glip af en hel flok fugle, der ønsker at bryde igennem dit websted. For at gøre dette skal du klare forhindringer og lukke dem, hver gang en fugl forsøger at glide ind i en åben passage. Fuglene selv er skyldige, de blev forklaret, at det ikke er værd at flyve i denne retning, men af en eller anden grund lytter de ikke til det, og nu bebrejder de sig selv for Flapi Smash.
