Du kender sikkert til fantomer eller spøgelser fra science fiction-film og bøger, men heltinden i spillet Phantom Manor ved navn Ashley har evnen til at se spøgelser, selvom det ikke sker så ofte. Første gang så hun et spøgelse, som dukkede op på et tidspunkt, hvor skatte tilhørende pigens familie blev stjålet. Siden da, deres slags forfølgere af fiasko, gik de konkurs og blev tvunget til at flytte fra deres familieejendom til et lille hus. Heltinden ønsker at vende tilbage til sit tidligere velbefindende og har til hensigt at finde et fantom, hun er sikker på, at han på en eller anden måde er involveret. Men for dette bliver hun nødt til at infiltrere sit tidligere palæ i Phantom Manor.