En ondsindet hacker er dukket op i den kybernetiske verden, som ønsker at ødelægge alt omkring. Du i spillet Cyberchase Quest 1: Motherboard bliver nødt til at neutralisere det. I begyndelsen af spillet vil du gå til et særligt laboratorium, hvor du vil skabe en karakter til dig selv, som vil være udstyret med visse evner. Derefter vil du se helten foran dig. Du får opgaver af en robotpige. Alle vil være relateret til søgningen efter hackeren. Du bliver nødt til at fuldføre disse quests. Ganske ofte, for at fuldføre den næste opgave, skal du løse et bestemt puslespil eller rebus. Så snart alle quests er gennemført, vil du være i stand til at neutralisere hackeren og redde denne verden i Cyberchase Quest 1: Motherboard-spillet.