Koøje-puslespillet er manipulation af farvede portaler for at levere en bold fra venstre rør til højre. Mellem dem er der ledig plads, og du kan bevæge dig ved hjælp af specielle portaler. For at gøre dette skal de placeres på en sådan måde, at bolden glider igennem og hopper lige ind i det tilstødende rør. Portaler af forskellige farver kombineres ikke, du skal først flytte bolden gennem de samme passager og derefter flytte til andre. Nogle gange vil der være flere portaler end nødvendigt, det er ikke nødvendigt at bruge alt i koøjen.
