Livet for en lille heks ved navn Elsa er i fare. På Halloween aften angreb monstre hendes hus. Heksen kom ud af huset og nu går hendes vej gennem skoven til hendes bedstemors hus. Du i spillet Spooky Run bliver nødt til at hjælpe heltinden med at komme til sin destination. Foran dig på skærmen vil du se en skovsti, langs hvilken din heltinde gradvist vil tage fart. Se omhyggeligt på skærmen. På hendes vej vil der være forskellige forhindringer og fælder. Når du styrer heltinden, skal du sørge for, at hun løber rundt om dem alle. Hjælp hende på vejen med at samle græskar, guldmønter og andre nyttige ting, der ligger på vejen. For deres valg i spillet Spooky Run vil du blive givet et vist antal point. Din heltinde vil også være i stand til at modtage forskellige midlertidige bonusser, der vil hjælpe hende med at overleve.
