I Codename: CORE hjælper du en hemmelig agent med at kæmpe mod en invaderende hær, der består af forskellige robotmodeller. Foran dig vil din karakter være synlig på skærmen, som vil være placeret på bygningens tag. Robotter vil bevæge sig mod ham. Du, der styrer din karakter, bliver nødt til at flytte den rundt på spillefeltet, hvilket dermed ville gøre det svært at sigte mod helten. Sigt mod robotter, og åben ild mod dem for at dræbe. Ved at skyde præcist vil du ødelægge robotter og for dette vil du få point i spillet Codename: CORE.