I en stor metropol har der været flere ulykker på rørledningen, hvorigennem vand kommer ind i byen. Du i spillet Pipes: The Puzzle bliver nødt til at reparere rør. Et bestemt område vil være synligt på skærmen foran dig. Rør vil være under jorden. Med musen kan du rotere nogle af dem i rummet. Din opgave er at blotlægge rørene, så de er forbundet med hinanden. Så snart hele rørledningen er genoprettet, vil der løbe vand igennem den. Så snart den kommer ind i byen, får du point i spillet Pipes: The Puzzle, og du vil fortsætte med at reparere den næste sektion.
