Helten i spillet Cleaning the Islands endte på en øde ø, men han vil slet ikke give op, han har værktøjer, stærke hænder og et ønske om at lave et paradis ud af øen. Men du skal arbejde hårdt, og først skal du udforske de nærliggende øer, som har en masse mineraler og ressourcer. Først og fremmest er det træ, så sten, så vil helten dyrke hvede og så videre. Indfødte hjælpere vil dukke op, og snart vil handelsskibe fortøje til kysten, og du har noget at tilbyde dem. Livet vil rase, arbejde utrætteligt, og snart vil øen være fyldt med bygninger og liv i Cleaning the Islands