Heltinden i spillet Run Healthy føler sig udmattet og hoster, hvilket tydeligt indikerer begyndelsen af en forkølelse. For at forhindre utilpasheden i at udvikle sig til mere alvorlige konsekvenser, skal den destrueres ved roden. Af denne grund vil den såkaldte sunde jogging begynde. Mens du løber let, guide heltinden til at samle sund mad og undgå fedtede burgere. Skalaen over pigens hoved skal genopfyldes for at give dem et værdigt afslag, når de støder på vira. Ved målstregen skal du igennem flere træningsmaskiner: et løbebånd, løfte en vægtstang osv. Alt dette er for at forbedre sundheden. Som et resultat vil pigen blive munter og helt sund i Run Healthy.
