De besætninger af køer, du har til din rådighed i Paint Cow, er ikke nemme. Køerne har forskellige farver i dem, men de kan ikke lide det. Derfor skal du på hvert niveau sikre, at alle køerne er ens. For at gøre dette skal du klikke på de fremhævede fliser med kohoveder og gradvist ændre de resterende dyr til en anden farve, indtil du opnår, at alle hovederne har samme farve. Antallet af trin for at fuldføre en opgave er begrænset. Spillet har femten typer felter med forskellige størrelser og hver har op til tres niveauer i Paint Cow.
