Gelémanden står ved starten i Runner Blob 3D og er klar til at løbe, så snart du giver ham grønt lys. Forude er et spor fyldt til randen med forskellige forhindringer, og de er alle i større eller mindre grad trusler mod gelémanden, fordi han bliver nødt til at miste en del af sig selv, mens han overvinder dem. Men det, du har mistet, kan gøres op, hvis du behændigt samler gelékugler under friløbet. Spørgsmålet er, hvorfor helten besluttede sig for et så farligt løb. Og det hele handler om lilla krystaller, der skal indsamles for at have vægt i den verden, hvor helten bor i Runner Blob 3D.
