I modsætning til populær tro bruges ædelsten ikke kun til fremstilling af forskellige smykker. Faktisk bruges mange krystaller i forskellige industrier, og i fantasiverdenen bruges de af tryllekunstnere og troldmænd til at lave forskellige eliksirer for at forbedre besværgelsernes arbejde. Rygtet siger, at potions lavet af ædelsten er særligt kraftfulde, tilsyneladende fordi de ikke er så nemme at lave. I Wooden Jewels bliver du en troldmandslærling. Han har brug for at genopfylde sine eliksirer. De skal altid være i reserve, man ved aldrig, hvad der kan ske. For at fylde flaskerne skal du lave linjer af tre eller flere identiske sten i træjuveler på spillebanen.
