Ofte afspejles fortidens begivenheder i nutiden, og dette sker, fordi begivenheden ikke fik sin logiske konklusion eller kræver hævn. Dette er, hvad der skete i Samurai Rurouni Wars med en samurai i ånden, men en vagabond i det væsentlige. Han rejser verden rundt og kæmper mod skurke. Tidligere blev hans far forrådt af dem, han aldrig troede var muligt, og dette gjorde samuraien til, hvad han blev - en ronin. Han ønsker ikke at tjene én herre, hans lod er ensomhed og den evige kamp mod det onde. Du vil hjælpe helten med at flytte fra domæne til domæne for at udrydde den onde skikkelse af grusomme samurai, der har taget til den mørke side i Samurai Rurouni Wars.
