I Bubble Blitz Galaxy har du mulighed for at erobre en ukendt galakse, men for at gøre dette bliver du nødt til at kæmpe med farverige bobler, der kategorisk ikke ønsker at se fremmede på deres territorium. Men hvis du viser din styrke og smidighed, kan boblerne trække sig tilbage. Målet er at forhindre bobler i at krydse den nedre grænse. For at gøre dette skal du skyde boblerne med farvede kugler og danne grupper af tre eller flere identiske bobler side om side. Sådanne grupper holder ikke sammen med den generelle masse, de eksploderer og forsvinder ind i Bubble Blitz Galaxy.
