De røde og blå stickmen er svorne fjender i livet, men det skete så, at de begge endte i den samme fængselscelle i Stick Bros Leave Prison. De kommer ikke til at sidde sammen, og det er ikke hensigtsmæssigt at arrangere et opgør i en trang celle. Fangerne besluttede først at forene sig og flygte, og derefter kunne de håndtere hinanden i naturen. I mellemtiden bliver I nødt til at agere sammen, ligesom du og din partner, hvis I spiller sammen. Du kan dog spille alene og styre karaktererne én efter én. Tryk på C-tasten for at skifte fra den ene til den anden. Overvind forhindringer, saml nøgler for at åbne døren til et nyt niveau. Hvis en af stickmen fejler, og niveauet ikke er fuldført, kan du gå gennem hans vej igen i Stick Bros Leave Prison.
