En hær af Skibidi Toiletter angreb en stor metropol, og det kom som en komplet overraskelse. I ret lang tid har ingen hørt om disse mutanter. De blev gentagne gange besejret og smidt ud af verden, og selv hæren blev fjernet fra store byer og omdirigeret til militærbaser. Tilsyneladende opererer toiletmonstrene efterretninger på et meget højt niveau, så de sendte deres krigere på et tidspunkt, hvor der ikke var nogen til at beskytte befolkningen. Derfor vil du kæmpe tilbage mod dem i spillet Skibidi Ninja. Din helt vil være bevæbnet med et sværd, men han bruger det mesterligt. Foran dig på skærmen vil du se et sted, hvor Skibidi Toilets vil se ud i bevægelse med forskellige hastigheder. Du bliver nødt til at vælge mål og slå dem med ødelæggende slag. Dette kan gøres ved hjælp af musen. Forestil dig, hvordan du giver et skærende slag og stryger mod toiletmonsteret, mens du holder venstre knap nede. På denne måde vil du skære Skibidi Toilets i stykker og få point for dette i Skibidi Ninja-spillet. Pas på, der kan være bomber blandt dine modstandere. Du bør under ingen omstændigheder røre ved dem. Hvis du rører blot én bombe, vil en eksplosion forekomme, og du vil tabe runden. Du har ikke mange forsøg til rådighed for at fuldføre missionen, så det er vigtigt at være forsigtig og ikke lave fejl.
