På en afsidesliggende ø et sted i havet, væk fra nysgerrige øjne, er der et hemmeligt laboratorium, hvor der udføres eksperimenter på genetisk niveau. Her i Merge Animals - Mutant Fight skabes monstre, og du vil deltage i deres skabelse. Et fuldgyldigt monster skal se skræmmende ud og være i stand til at stå op for sig selv, så efter mutanten er skabt, skal den testes. Din skabelse bliver nødt til at deltage i en duel med en anden mutant, og hvis dit valg af forskellige dele: hoved, torso, poter, horn og så videre er vellykket, vil dit monster vinde. Efter hver sejr vil der blive tilføjet nye reservedele til sparegrisen for at skabe en ny mutant i Merge Animals - Mutant Fight.
